Когда пролетающая комета внезапно меняет курс и устремляется к Земле, начинается широкомасштабная паника, объявляется чрезвычайное положение и люди готовятся к Армагеддону. Однако, комета не падает, вместо этого она замедляет ход, планирует и, в конце концов, приземляется на озеро в Тихоокеанском Северо-Западе.

Наконец, 4400 человек появляются из ослепительно-белого света, это люди из разных поколений и разного общественного положения, которых считали погибшими или пропавшими без вести, и никто из них не постарел ни на день с тех пор, как их видели в последний раз. Будто кто-то решил сохранить этих людей для будущего неизменёнными и нетронутыми временем.

Хотя сразу это и не заметно, скоро становится очевидным, что каждый из 4400 вернулся со специальной способностью, поскольку они начинают невольно проявлять возможности, такие как нечеловеческая сила, исцеление и ясновидение. Они стремятся посетить места из своего прошлого и воссоединиться с теми, кого оставили. Два мира сталкиваются, когда 4400 людям, привыкшим жить в прошлом, приходится справляться с проблемами современной жизни.

Новое федеральное подразделение Министерства национальной безопасности под названием НКОУ (Национальное Командование по Оценке Угрозы) создаётся под управлением Тома Болдуина, следователя по уголовным делам, и Дианы Скорис, биомедика. У Тома есть личные мотивы: его племянник Шон был одним из 4400 похищенных и если бы не Шон, похитили бы его сына Кайла.

Расследуя одно дело за другим, Том и Диана понемногу начинают проливать свет на тайну 4400. Наконец, на том самом пляже, откуда похитили Шона, они узнают правду о случившемся: 4400 были похищены не пришельцами, а людьми, живущими в сотнях тысяч лет в будущем. Находясь на конечной стадии эволюции человека и явно желая усовершенствовать своих предков, они отослали назад 4400, чтобы те сыграли ключевую роль в грядущих событиях, которые повлияют на будущее человечества.